비상장주식 양도세 9월 신고 총정리｜소액주주·대주주 반드시 알아야 할 핵심 포인트

주식 투자를 하다 보면 세금 신고라는 단어만 들어도 머리가 지끈거리는 분들이 많으실 거예요. 특히 올해부터는 비상장주식과 장외거래에서 발생한 양도차익까지 소액주주도 신고 대상이 되면서 더더욱 혼란스러워하시는 분들이 많습니다. 혹시 나는 소액주주라 괜찮겠지 하고 그냥 넘어가려던 건 아니신가요?

2025년 상반기 주식 거래로 양도차익이 생겼다면, 오는 9월 1일(월)까지 반드시 신고·납부해야 하는데요. 기한을 놓치면 무신고 가산세와 납부불성실 가산세까지 더해져 세금 부담이 눈덩이처럼 불어날 수 있습니다. 그래서 이번 글에서는 투자자분들이 꼭 알아야 할 비상장주식 양도세 신고 방법과 핵심 포인트를 정리해 드리려고 해요.

이번 내용을 끝까지 읽으시면 “내가 신고 대상인지”, “어떤 세율이 적용되는지”, “어떻게 신고해야 하는지”까지 한 번에 이해하실 수 있습니다. 그럼 하나씩 차근차근 알아볼까요?

2025년 비상장주식 양도세 신고 기한은 언제일까?

올해 상반기(1월~6월) 동안 주식을 양도하신 분들이라면 2025년 9월 1일(월)까지 양도소득세를 반드시 신고·납부해야 합니다. 이 날짜를 놓치면 단순히 세금을 내는 것으로 끝나지 않고, 무신고 가산세 20%와 납부불성실 가산세까지 더해져 예상보다 훨씬 큰 금액을 부담하게 될 수 있습니다.

주식투자를 하면서 세금 신고를 가볍게 생각하시는 분들이 종종 있는데요. 실제로 “나는 소액주주인데 왜 신고해야 하지?”라는 질문을 많이 받습니다. 하지만 올해부터는 소액주주도 장외거래를 했다면 반드시 신고 대상이 된다는 점을 명심하셔야 해요.

예를 들어, 인천에 사는 직장인 A씨가 2025년 4월에 보유하고 있던 비상장회사 주식을 장외에서 팔아 2천만 원의 차익을 얻었다고 가정해 보겠습니다. 예전 같으면 소액주주라 세금 신고를 하지 않아도 된다고 생각했을 수 있지만, 올해부터는 상황이 완전히 달라졌습니다. 이제는 소액주주라도 이런 거래가 있다면 9월 1일까지 양도세 신고를 꼭 해야 합니다.

만약 이를 모르고 신고하지 않으면 어떻게 될까요? 국세청은 이미 증권사와 연계된 데이터를 수집해 거래내역을 확인하고 있습니다. 따라서 신고를 누락했다면 안내문 없이도 세무조사나 가산세 부과가 바로 이뤄질 수 있어요. “나는 안내문을 못 받았으니 괜찮겠지”라는 생각은 위험합니다.

정리하자면, 올해 상반기 주식 거래로 양도차익이 발생한 모든 투자자는 9월 1일(월)이라는 날짜를 달력에 굵게 표시해 두셔야 합니다. 이 기한을 넘기면 가산세 부담과 함께 불필요한 세무 리스크를 떠안게 되니, 반드시 챙기시길 바랍니다.

구분	신고 기한	주의사항
상반기 주식 양도	2025년 9월 1일	기한 내 미신고 시 가산세 부과
하반기 주식 양도	2026년 2월 말	별도로 신고·납부 필요

누가 신고 대상일까? (소액주주·대주주 차이)

주식 양도세 신고에서 가장 중요한 것은 바로 ‘내가 신고 대상인지 아닌지’입니다. 많은 분들이 소액주주라면 신고를 안 해도 된다고 생각하시지만, 2025년부터는 그렇지 않습니다. 특히 비상장주식 양도와 상장주식 장외거래는 대주주와 소액주주 모두 신고 대상이 된다는 점이 핵심이에요.

신고 대상은 크게 세 가지 그룹으로 나뉩니다.

• 상장주식 대주주 – 코스피 1% 이상, 코스닥 2% 이상, 코넥스 4% 이상 보유하거나 종목별로 50억 원 이상 보유 시 과세 대상
• 상장주식을 장외거래한 소액주주 – 거래소를 통하지 않고 증권계좌로 직접 이체했다면 올해부터 반드시 신고해야 함
• 비상장주식을 양도한 주주 – 원칙적으로 모두 과세 대상. 단, K-OTC에서 중소·중견기업 주식을 거래한 소액주주는 예외

예를 들어볼까요? 평소 장내 거래만 하던 B씨가 이번에 비상장회사의 지분을 지인에게 장외로 넘기면서 1천만 원의 차익을 얻었습니다. 이전에는 “나는 대주주가 아니니까 신고할 필요 없어”라고 생각했을 수 있습니다. 하지만 2025년부터는 이런 경우도 과세 대상이 되므로 신고를 하지 않으면 가산세를 물어야 합니다.

반대로 코스닥에 상장된 기업 주식을 소액으로 보유하고 있다가 장내(거래소를 통한 정상 매매)에서 매도한 경우라면, 소액주주는 여전히 신고 대상이 아닙니다. 결국 핵심은 ‘어떤 방식으로 거래했는가’라는 점이에요.

따라서 본인의 거래가 장내인지, 장외인지, 비상장인지 정확히 구분하는 것이 가장 중요합니다. 만약 스스로 헷갈린다면 홈택스 신고도움 서비스에서 거래내역을 확인하거나 세무 전문가에게 상담을 받아보는 것이 좋습니다.

주식 구분	장내 거래	장외 거래
상장주식	대주주만 신고	대주주·소액주주 모두 신고
비상장주식	K-OTC 소액주주 예외	대주주·소액주주 모두 신고

장외거래, 왜 소액주주도 신고해야 하나요?

많은 투자자분들이 가장 혼동하는 부분이 바로 장외거래입니다. “시간외매매도 장외거래 아닌가요?”라고 질문하시는 분들이 많지만, 사실은 다릅니다. 시간외매매는 거래소를 통하는 장내거래이고, 장외거래는 거래소를 거치지 않고 계좌 간 직접 이체로 주식이 옮겨가는 거래를 뜻합니다.

즉, 증권사 계좌에서 상대방 계좌로 주식이 직접 넘어가는 방식이 바로 장외거래예요. 이런 거래는 예전에는 대주주만 과세 대상이었지만, 2025년부터는 소액주주도 의무적으로 신고해야 합니다. 국세청은 이미 증권사 자료를 수집하고 있기 때문에 신고를 누락하면 안내문을 받지 않아도 세무조사 위험이 커질 수 있습니다.

예를 들어, 서울에 사는 40대 투자자 C씨가 비상장법인의 주식을 지인에게 직접 양도해 3천만 원의 차익을 얻었다고 해볼까요? 예전 같으면 소액주주라 신고하지 않아도 될 거라 생각했겠지만, 올해부터는 이런 거래도 철저히 과세 대상이 됩니다. C씨가 신고하지 않으면 국세청은 해당 거래 내역을 확인해 가산세까지 부과할 수 있어요.

다만 예외도 있습니다. 최근 출범한 대체거래소 넥스트레이드에서 거래한 경우는 장내거래로 간주되기 때문에 소액주주라면 신고 대상이 아닙니다. 따라서 거래소 플랫폼을 통한 매매인지, 단순 계좌 이체인지 구분하는 것이 매우 중요합니다.

정리하면, 장외거래는 대주주와 소액주주 모두 신고 대상이고, 시간외매매는 장내거래라 신고 대상이 아니며, 넥스트레이드 같은 대체거래소 거래도 신고 의무에서 제외됩니다. 따라서 본인의 거래 방식이 어디에 해당하는지를 명확히 아는 것이 절세의 첫걸음입니다.

거래 방식	신고 의무 여부	비고
장내거래 (코스피·코스닥·코넥스)	대주주만 신고	소액주주는 신고 제외
장외거래 (계좌 직접 이체)	대주주·소액주주 모두 신고	2025년부터 소액주주 포함
시간외매매	신고 제외	장내거래로 간주
넥스트레이드 거래	신고 제외	장내거래로 인정

비상장주식 양도세율과 계산 방법

비상장주식 양도세를 이야기할 때 빼놓을 수 없는 것이 바로 세율입니다. 많은 분들이 “얼마나 세금을 내야 하는지”를 가장 궁금해하시는데요. 세율은 주식의 종류와 보유 기간에 따라 달라집니다.

세율 기준

• 비상장주식 – 중소기업: 10%, 일반기업: 20%
• 상장주식 대주주 – 양도차익 3억 이하: 20%, 3억 초과: 25%
• 상장주식 단기 보유 – 1년 미만 보유 시 30% 적용

계산 방식도 간단히 정리해 드릴게요. 기본적으로는 양도가액 – 취득가액 – 필요경비 = 양도차익입니다. 여기에 기본공제 250만 원을 뺀 금액에 세율을 곱하면 내야 할 세금이 산출됩니다.

예를 들어, D씨가 비상장 일반기업 주식을 양도해 5천만 원의 차익을 얻었다고 가정해 보겠습니다. 이 경우 세율은 20%가 적용되며, 양도차익 5천만 원에서 기본공제 250만 원을 뺀 4,750만 원에 세율을 곱하게 됩니다. 즉, 약 950만 원을 세금으로 납부해야 하는 것이죠.

또 하나 중요한 점은 손익통산입니다. 같은 반기 내에 손실이 발생한 거래가 있다면, 이 손실을 합산해 세금을 줄일 수 있습니다. 따라서 단순히 이익만 보는 것이 아니라 전체 거래 내역을 꼼꼼히 따져보는 것이 절세에 큰 도움이 됩니다.

마지막으로, 양도세와 별도로 증권거래세도 있다는 사실을 잊지 마셔야 합니다. 증권거래세는 양도차익이 없어도 부과되므로 반드시 함께 확인하셔야 합니다.

구분	세율	비고
비상장주식 (중소기업)	10%
비상장주식 (일반기업)	20%
상장주식 대주주 (양도차익 3억 이하)	20%
상장주식 대주주 (양도차익 3억 초과)	25%
상장주식 단기 보유 (1년 미만)	30%	단기 투기 억제 목적

올해 달라진 세법, 대주주 기준 강화와 이월과세

2025년부터 주식 투자자들이 반드시 주목해야 할 변화는 바로 대주주 기준 강화와 이월과세 제도 도입입니다. 이 두 가지는 투자 전략에도 큰 영향을 미치므로 미리 숙지하셔야 합니다.

먼저, 대주주 기준이 달라집니다. 지금까지는 종목당 50억 원 이상 보유해야 대주주로 분류됐지만, 세제 개편안에 따라 앞으로는 10억 원 이상만 보유해도 대주주로 간주됩니다. 이는 국회에서 최종 확정 후 2026년 신고부터 적용될 예정이지만, 이미 투자자들 사이에서는 “이제는 대주주 범위가 크게 늘어난다”는 경각심을 불러일으키고 있습니다.

대주주가 되면 양도소득세율이 일반 소액주주보다 높게 적용되고, 주식 이동이나 증여 시에도 부담이 커질 수 있습니다. 따라서 보유 종목의 가치를 미리 점검하고 대응 전략을 세워두는 것이 필요합니다.

두 번째 변화는 이월과세 제도의 도입입니다. 2025년 1월 1일 이후 증여받은 주식을 1년 내 양도할 경우, 기존에는 증여 당시의 가액을 기준으로 양도차익을 계산했지만 이제는 증여자의 취득가액을 기준으로 계산해야 합니다. 이는 조세회피를 방지하기 위한 제도인데요, 단기간에 증여와 매도를 반복하며 세금을 줄이는 방식을 막기 위한 취지입니다.

예를 들어, 부모님이 보유하던 주식을 자녀에게 증여하고, 자녀가 곧바로 이를 매도하는 경우를 생각해 보세요. 예전에는 증여 시점의 가액으로 계산되니 세금 부담이 줄 수 있었지만, 앞으로는 부모님이 최초 취득한 가액을 기준으로 세금이 계산됩니다. 즉, 절세 목적의 단기 증여 전략은 더 이상 통하지 않게 된 것입니다.

이처럼 세법은 매년 변화하고, 작은 개정 하나가 투자자에게 큰 영향을 미칠 수 있습니다. 따라서 세무 뉴스를 꾸준히 확인하고, 본인의 보유 종목과 거래 내역이 새로운 제도에 어떤 영향을 받는지 미리 점검하는 것이 중요합니다.

변경 내용	기존	개정 후
대주주 기준	종목당 50억 원 이상	종목당 10억 원 이상
이월과세	증여 당시 가액 기준	증여자의 취득가액 기준

국세청 홈택스 신고 방법과 편리해진 서비스

양도세 신고라고 하면 복잡한 계산과 서류 작업을 떠올리며 겁부터 내시는 분들이 많습니다. 하지만 다행히도 최근 국세청은 홈택스 시스템을 대폭 개선해 훨씬 편리하게 신고할 수 있도록 지원하고 있습니다.

홈택스 신고 절차는 다음과 같습니다.

1. 국세청 홈택스 접속 → 로그인
2. 상단 메뉴에서 세금신고 → 양도소득세 → 간편신고/일반신고 선택
3. 신고도움 서비스에서 거래내역 확인
4. 자동 입력된 항목 확인 후 수정/보완
5. 세액 계산 후 전자납부 진행

특히 이번부터는 미리채움 서비스가 장외거래자까지 확대됐습니다. 즉, 거래일자, 양도가액, 주식 수량 등 주요 항목이 자동 입력되어 납세자는 확인만 하면 되는 구조로 바뀐 것이죠. 덕분에 과거보다 신고 과정이 훨씬 간편해졌습니다.

또한, 세율 선택 도우미와 주식양도 신고도우미 기능이 추가되어 복잡한 세율 적용이나 손익통산 계산을 쉽게 처리할 수 있습니다. 국세청은 안내문도 카카오톡, 네이버 앱을 통해 모바일로 발송하고 있으며, 60세 이상이나 모바일 수신이 어려운 분들에게는 우편 안내문을 별도로 보내고 있습니다.

예를 들어, E씨가 장외에서 상장주식을 매도하고 홈택스를 통해 신고하려는 상황을 가정해 보겠습니다. 예전 같으면 거래내역을 직접 입력해야 해서 누락 위험이 컸지만, 이번에는 대부분의 내역이 자동으로 입력되어 큰 실수 없이 신고를 마칠 수 있습니다. 이처럼 홈택스 서비스는 단순 신고를 넘어, 신고 누락 방지를 위한 안전장치 역할도 하고 있습니다.

따라서, 거래 내역을 정확히 확인하고 홈택스 시스템을 적극 활용한다면 복잡해 보이던 양도세 신고도 훨씬 수월하게 끝낼 수 있습니다.

홈택스 서비스	내용
미리채움 서비스	거래일자, 양도가액 등 자동 입력
세율 선택 도우미	적용 세율 자동 안내
주식양도 신고도우미	손익통산·계산 지원
모바일 안내문	카톡·네이버 앱 발송, 60세 이상은 우편

신고를 놓치면 생기는 불이익 (가산세·세무조사 리스크)

주식 양도세 신고에서 가장 무서운 부분은 바로 신고를 놓쳤을 때의 불이익입니다. 단순히 세금을 내는 것에서 끝나지 않고, 신고를 하지 않거나 늦게 하면 추가적인 가산세와 세무조사 리스크가 뒤따르게 됩니다.

가장 먼저 무신고 가산세가 부과됩니다. 이는 납부해야 할 세액의 20%를 추가로 내야 한다는 뜻입니다. 예를 들어, 원래 양도세가 500만 원이었다면, 100만 원을 더 내야 하는 것이죠. 여기에 납부불성실 가산세까지 붙게 되면 세금은 눈덩이처럼 불어나게 됩니다.

또한, 반복적으로 신고를 누락하거나 의도적으로 누락한 정황이 발견되면 세무조사 대상이 될 가능성이 높아집니다. 특히 주식 거래는 자금 흐름과 연결되기 때문에, 세무조사가 시작되면 상속·증여세 등 다른 세금 문제로까지 번질 수 있습니다. 한 번의 실수로 세금 리스크가 전방위적으로 커질 수 있는 셈입니다.

실제로 지난해에도 신고 안내문을 받았음에도 불구하고 신고하지 않은 투자자들이 세무조사 대상이 된 사례가 적지 않았습니다. 단순히 세금을 조금 아끼려다 오히려 수천만 원의 가산세와 세무조사 부담을 떠안게 된 것이죠.

따라서 가장 확실한 절세 전략은 기한 내에 성실히 신고하는 것입니다. 신고를 제대로 하면 세무조사 리스크를 피할 수 있고, 가산세 부담도 전혀 생기지 않습니다. 이 단순한 원칙을 지키는 것이 가장 큰 절세 노하우라고 할 수 있습니다.

불이익 유형	내용
무신고 가산세	세액의 20% 추가 부담
납부불성실 가산세	세금 납부 지연 시 이자 개념의 가산세 부과
세무조사 리스크	자금출처 조사, 상속·증여세로 확대 가능

안전하게 신고하는 방법과 세무사 상담 포인트

양도세 신고는 홈택스를 통해 혼자서도 가능하지만, 거래 내역이 복잡하거나 세법 변화가 자주 발생하는 만큼 세무 전문가와 상담하는 것이 훨씬 안전할 때가 많습니다. 특히 비상장주식 거래는 증여, 상속, 지분 이전 등 다양한 변수가 얽혀 있어 신고를 잘못하면 큰 불이익을 볼 수 있습니다.

세무사 상담을 고려해야 하는 대표적인 상황은 다음과 같습니다.

• 비상장주식을 지인이나 가족에게 양도한 경우
• 여러 종목에서 손익이 동시에 발생해 손익통산 계산이 필요한 경우
• 증여와 양도가 혼합되어 과세 여부 판단이 어려운 경우
• 대주주 기준 강화로 앞으로 과세 대상에 포함될 가능성이 있는 경우

세무사와 상담할 때는 단순히 “세금 신고를 해주세요”가 아니라, 절세 전략까지 함께 문의하는 것이 좋습니다. 예를 들어, 손익통산을 어떻게 활용하면 유리한지, 내년부터 달라지는 대주주 기준에 대비해 어떤 방식으로 주식을 보유하면 좋을지, 증권거래세와 양도세를 동시에 어떻게 관리해야 하는지 등을 함께 검토해 보는 거죠.

또한, 세무 전문가와 함께하면 세법 해석의 불확실성을 줄이고, 혹시 모를 세무조사 리스크에도 대비할 수 있습니다. 실제로 많은 투자자분들이 혼자 신고하다가 실수를 범한 뒤 뒤늦게 세무사를 찾곤 합니다. 처음부터 전문가와 함께했다면 훨씬 더 효율적이고 안전하게 신고를 마칠 수 있었을 것입니다.

결론적으로, 양도세 신고는 단순히 기한 내 신고·납부를 넘어, 내 자산을 지키는 절세 전략의 중요한 과정입니다. 혼자 하기 불안하다면 주저하지 말고 전문가의 도움을 받으시길 권합니다. 이 한 걸음이 수백만 원의 세금 차이를 만들어 줄 수도 있습니다.

상담 포인트	내용
손익통산 활용	손실과 이익을 합산해 세부담 줄이는 방법
대주주 기준 대비	보유 종목 가치 조정 및 증여·양도 전략
증권거래세 병행 관리	양도세와 별도로 발생하는 세금 체크
세무조사 예방	신고 정확성 확보 및 리스크 관리